长牡蛎(Crassostrea gigas)中ChIP-seq 方法的建立     

展望  王文  施威扬 《海洋与湖沼》2015,46(6):1557-1563

染色质免疫共沉淀技术(ChIP)作为研究DNA 结合蛋白与DNA 相互作用最有力的工具, 越 来越受到重视。但目前该技术在牡蛎等贝类中的应用尚未见相关报道。为了研究长牡蛎早期胚胎发 育过程中表观遗传信息的变化模式, 本文在长牡蛎胚胎中探索并建立了一套完整的染色质免疫共沉 淀方法, 构建了高质量的高通量测序文库, 首次获得了牡蛎全基因组水平的组蛋白H3K4me3 修饰分 布, 从而为研究牡蛎的表观遗传调控奠定了基础。  相似文献   

Additions to the echinoid fauna of New Zealand     

D. G. McKnight 《新西兰海洋与淡水研究杂志》2013,47(1):90-110

Seven species of echinoids are added to the New Zealand fauna, two being described as new species of the genera Caenopedina and Spatangus Described species, new to the fauna, are Gracilechinus multidentatus (H. L. Clark), Pourtalesia laguncula A. Agassiz, Hemiaster expergitus gibbosus A. Agassiz, and Gymnopatagus magnus A. Agassiz and H. L. Clark. Fragments of Spatangus, possibly hybrid S. thor Fell, and fragments of Echinocardium, almost certainly not E. cordatum (Pennant), are also described.  相似文献   

微生物絮凝剂投加方式对好氧颗粒污泥性能的影响     

宋志伟  王秋旭  宁婷婷  任南琪  李立欣 《吉林大学学报(地球科学版)》2015,45(1):247-254

为提高好氧污泥颗粒化速度, 采用微生物絮凝剂, 探讨在好氧颗粒污泥培养过程中微生物絮凝剂的投加方式对颗粒污泥理化性能及生物降解效能的影响。结果表明:微生物絮凝剂每隔2、3、5、7 d投加一次时, 均可培养出成熟的好氧颗粒污泥, 微生物絮凝剂的投加方式对好氧污泥颗粒化的影响较显著;微生物絮凝剂最佳投加方式为每5天投加一次, 此时颗粒化速度快, 颗粒形成时间由未投加的60 d缩短为42 d, 好氧颗粒污泥疏水性好, 污泥体积指数稳定在40 mL/g左右, 沉降速度达35.06 m/h, COD、氨氮和总磷的去除率分别为96.55%、93.29%和87.29%。  相似文献   

阿特拉津低温降解菌的筛选及降解机理研究   总被引：1，自引：1，他引：0  

刘娜  毕海涛  任何军  姬克宁  郑松志 《吉林大学学报(地球科学版)》2009,39(5)

以阿特拉津为唯一氮源, 在低温条件下(10℃),从吉林市污水处理厂的活性污泥中分离、筛选出1株能够高效降解地下水中阿特拉津的菌株W4.通过16S rDNA碱基测序和比对,初步确定该菌为假单胞菌属;通过室内降解条件优化,确定W4的最佳降解条件:初始pH范围为7～9,最佳碳源为蔗糖和乳糖,最佳碳源加入量为0.4 g/L.在最佳降解条件下,W4对初始质量浓度为34 mg/L、22 mg/L和10 mg/L的阿特拉津的生物降解反应符合零级反应动力学方程,对初始质量浓度为5 mg/L的阿特拉津的生物降解反应符合一级反应动力学方程.GC/MS分析结果显示,菌株W4降解阿特拉津遵循氯水解途径,代谢产物为2-羟基-4-乙胺基-6-异丙胺基-1,3,5-三嗪.  相似文献   

Phylogeny of the Sepia officinalis species complex in the eastern Atlantic extends the known distribution of Sepia vermiculata across the Benguela upwelling region     

AJE Healey  NJ McKeown  WM Potts  CL de Beer  W Sauer  PW Shaw 《African Journal of Marine Science》2017,39(3):307-313

Accurate species identification and biogeographic characterisation are fundamental for appropriate management of expanding cephalopod fisheries. This study addresses this topic within the common cuttlefish Sepia officinalis species complex (S. officinalis, S. hierredda and S. vermiculata), with an emphasis on occurrence in African waters. Tissue samples from the currently presumed distributions of S. vermiculata and S. hierredda (from South Africa and Ghana/Angola, respectively) were sequenced for the cytochrome c oxidase subunit I (COI) and the cytochrome b (cytb) genes of the mitochondrial genome and then compared to existing S. officinalis sequences. Three highly divergent and reciprocally monophyletic clades, corresponding to S. officinalis, S. hierredda and S. vermiculata, were resolved, representing the first molecular confirmation of the distinct species status of S. hierredda and S. vermiculata. The sequences also revealed that, contrary to expectations based on presently published information, all samples from southern Angola were S. vermiculata. These results indicate that the range of S. vermiculata extends beyond the currently described northern limit and that S. hierredda and S. vermiculata may be indiscriminately harvested in Angolan waters. Finer-scale patterns within S. vermiculata phylogeography also indicate that the Benguela Current System and/or other environmental factors serve to isolate northern and southern stocks.  相似文献   

象山港2013年夏季浮游细菌群落的时空分布特征   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈和平  朱建林  张德民  祝翔宇  郑凯宏  王凯 《海洋与湖沼》2018,49(6):1268-1278

港湾水域生态系统易受到人类活动的影响，而浮游细菌是维持海洋生态系统平衡和稳定的重要组成部分，其分布模式和动态变化可以反映人为活动对港湾生态系统的影响程度。本研究以宁波象山港这一受人类活动影响较大的代表性港湾为对象，研究了其夏季表层浮游细菌群落的空间分布特征及影响因子。结果表明，象山港各海区的浮游细菌α-多样性及均匀度总体上无显著差异。浮游细菌群落结构基本按海区聚类，海区间浮游细菌群落结构差异显著；分析相隔15天的两个航次的样品后发现，每个海区的浮游细菌群落结构均呈明显的时间演替。盐度、温度及营养盐是影响浮游细菌群落结构的主要环境因子。四个分别来自聚球藻属（Synechococcus）、OCS155、SAR11及α-变形菌纲的可操作分类单元（operational taxonomic units，OTUs）是造成海区间细菌群落差异的主要贡献类群。部分海区中，两个航次的样品存在相似功能潜力的标志性类群，可能是浮游细菌对海区水质长期响应的结果。本研究初步揭示了象山港夏季表层浮游细菌群落分布及其对港湾环境变化的响应模式，为评估港湾环境扰动的微生态效应提供了基础数据。  相似文献   

Denitrification Kinetics of High‐Strength Nitrate in Granular Sludge Reactors          下载免费PDF全文

Tulasi V. Krishna Mohan  Yarlagadda V. Nancharaiah  Vayalam P. Venugopalan  Pedapati M. Satya Sai 《洁净——土壤、空气、水》2018,46(8)

  相似文献   

中国明对虾混合养殖池塘沉积物微生物群落比较研究     

关晓燕  王摆  蒋经伟  田甲申  董颖  陈仲  高杉  王旭达  孙冰  段萍  赵泽龙  周遵春 《海洋通报》2020,39(6):730-739

微生物群落在养殖池塘生态系统中发挥着重要的作用，与环境质量及养殖动物的生长和疾病暴发密切相关。为了考察中国明对虾不同混养模式中的微生态状况，本研究基于 16S rRNA 基因的高通量测序技术，比较了 6 种不同中国明对虾混 养池塘沉积物微生物群落的差异。结果表明，6 种混养池塘沉积物的主要微生物均为变形菌门 （Proteobacteria） 和放线菌门（Actinobacteria），与褐牙鲆的混养，会导致变形菌门丰度升高，同时抑制放线菌门的生长。中国明对虾、海蜇、菲律宾蛤仔混养具有最高的沉积物微生物群落丰富度和多样性。通过对微生物功能进行预测发现，化能异养和含硫化合物的呼吸是中国对虾混养池塘沉积物微生物群落的主要功能。中国明对虾、海蜇、菲律宾蛤仔混养沉积物中部分细菌的某特异性富集，可以提高沉积物中溶解氧量并促进化学物污染物的降解。综上所述，中国明对虾、海蜇、菲律宾蛤仔混养模式在 6 种不同中国明对虾混养池塘中微生态状况最佳。  相似文献   

循环水养殖黑鲷(Acanthopagrus schlegelii)水体中循环率对水质因子和细菌群落多样性的影响     

李卢国  骆云慧  徐善良 《海洋与湖沼》2020,51(2):318-327

为探讨循环水养殖系统中循环率对水质因子和细菌群落多样性的影响,以黑鲷(Acanthopagrus schlegelii)为研究对象,研究了4次/天(低循环率)、8次/天(中循环率)、12次/天(高循环率)三个流量下,养殖桶和生物过滤桶两部分细菌群落结构、多样性以及细菌群落与环境因子的相关性。高通量测序结果表明:黑鲷循环水养殖中优势细菌类群为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和厚壁菌门(Firmicutes)。流量的升高可增加系统的细菌多样性,且高循环率过滤桶中具有净化水质降低营养盐功能的有益菌属更为多样化及丰度更高,同时,其系统去氨氮和总氮效果更好,去除率分别是49.5%和22.3%,氨氮去除率是低循环率组的2.9倍和中循环率的3.6倍,总氮去除率是低循环率组的8.2倍和中循环率组的20.5倍。PCoA分析和聚类分析结果表明,各实验组养殖桶与生物过滤桶中细菌群落组成有着明显的差异,中、高循环率组过滤桶菌落结构与低循环率的有明显的差异。环境因子与细菌群落结构相关性分析结果表明,总磷、活性磷酸盐、亚硝酸盐和总氮等指标对细菌群落结构影响相对较大,但未发现两者间有很显著的相关性。  相似文献   

泰国海域儒艮发声分类及特征          下载免费PDF全文

王晓燕  姜莹  刘宗伟  杨春梅  段德鑫  吕连港 《海洋科学进展》2022,40(2):320-326

为研究近海扇贝养殖水域水质、细菌种群分布规律以及微生物群落多样性对环境因子的响应,2019年5月至10月采集了青岛市崂山湾青山村近海栉孔扇贝养殖水域不同站位的海水样本,通过高通量测序方法分析了不同月份海水样本微生物群落结构和多样性的差异,探讨了环境因子与微生物群落结构的相关性。结果表明:①检测到变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门 (Firmicutes)等 52 个 细 菌 门,115 个 纲,其 中 变 形 菌 门 为 优 势 菌 门,主 要 包 括 γ-Proteobacteria 和α-Proteobacteria纲;②2019年9月,养殖区水样中细菌多样性升高,弧菌多样性下降,且细菌细胞数量达到最高点,说明该 养 殖 区 存 在 爆 发 弧 菌 病 的 可 能 性;③RDA 冗 余 分 析 表 明,浊 度 (P =0.027)对 养 殖 密 区 细 菌 OUT(OperationalTaxonomicUnits)水平的物种组成和群落结构具有显著的影响,硝酸盐(P=0.017)、浊度(P=0.033)对养殖疏区 OTU 水平的物种组成和群落结构具有显著的影响;④不同区域细菌门水平环境因子相关性 Heatmap图分析表明,养殖活动会影响近海细菌群落结构与环境因子的作用程度,从而增加病害发生的可能性。本研究可为贝类疾病的防治及近海海域生态系统的健康发展提供一定的理论基础。  相似文献